菌渣利用存在问题:
  1.菌渣利用的研究深度不够
  国内对菌渣利用的研究起步较晚，相对而言，国外研究较为成熟，甚至涉猎到环境保护、能量再生等方面。用作饲料、堆肥等方面机理的研究还存在着诸多问题，有待于进一步研究确定。专门针对食用菌菌渣堆肥工艺和参数控制研究较少。
  2.缺乏行业间的衔接与结合
  对于食用菌菌渣的研究利用大多只是针对一方面进行研究，对其利用有限，没有将菌渣各个方面的研究结合起来，对其综合高效地利用。
  由于食用菌产业的繁荣，如何处理好菌渣这一资源将会成为未来研究热点。如何利用好菌渣不仅是一个自然资源利用问题，而且对环境保护也具有重要意义。搞好菌渣的综合利用，可使农业、食用菌业、养殖业有机地结合起来，使自然资源得以良性循环，大大提高资源的利用率，有效地利用菌渣废料资源、变废为宝，对食用菌业良性持续发展具有重大的意义，有利于低碳经济社会的发展。